關于固相多肽合成這些雷你都避開了嗎？
拿著這個問題問問生科和化學的學生們，哪怕自己沒有操作過，很多人也能回答得差不多。畢竟固相多肽合成的出現，極大地催生了相關學科的發展。
現在，一說合成多肽，第一反應就是用固相多肽合成技術，產率佳，純度高，質量穩定，對環境友好……這個技術的優勢簡直太多了！
也正是因為固相多肽合成如此“好用”，自1920年多肽藥物胰島素問世以來，多肽藥物就重塑了在現代制藥領域的地位。在過去的20多年里，全球將近有近超過60種多肽類藥物獲得批準。根據一項全球多肽行業的數據分析，2016年至2024年多肽治療的年增長率將達到9.1%。多肽行業的發展，除了固相多肽合成技術的進步之外，現實的需求也很強勁，比如代謝疾病和癌癥發病率持續增加，需要更多多肽藥物來進行治療。當然，需求大，自然來錢多，最暢銷的治療代謝性疾病的多肽類藥物，例如利拉魯肽(Victoza)和類胰高血糖素肽1(GLP-1)每年至少有20億美元的銷售額[1]。
多肽泛指2～100個氨基酸經肽鍵連接形成的化合物，多肽藥物具有生物活性高，特異性強，副作用小等特點。從合成角度看，多肽藥物的制備主要有化學合成、基因重組及天然提取三種方法，其中固相化學合成多肽技術擁有產率佳，純度高，質量穩定，環境友好等優勢，被廣泛應用于3～50個序列的多肽原料藥生產。(2) 羧基脫保護和氨基酸活化的并行反應-生成加入肽鏈的下一氨基酸；在反應(1)中，原料是有保護基的氨基酸；在反應(2)中，需要多種試劑活化氨基酸的羧基。
無論什么反應，起始原料的純度都至關重要。在多肽固相合成中，原料Fmoc-氨基酸中的雜質主要源于Fmoc基團結合到氨基酸過程中的副反應，有以下三類：
這類雜質源于在氨基酸上接入Fmoc基團的試劑和已經成形的Fmoc-氨基酸發生副反應。二肽雜質存在會導致目標氨基酸重復插接。
在氨基酸中引入Fmoc基團時，Fmoc-OSu會發生開環和重排，形成β-丙氨酰類雜質。此類雜質存在會導致另一分子的的β-丙氨酸殘基(B)或β-丙氨酸(A)取代目標氨基酸插接到肽段
游離氨基酸源于氨基酸與Fmoc試劑的不完全反應。游離氨基酸存在會導致多個目標氨基酸重復插接肽鏈，導致Fmoc基團在Fmoc-氨基酸衍生物儲存過程中自動催化裂解。毫無疑問，這些雜質都會大大降低固相多肽合成的產率和純度，增大提純難度。相比于氨基酸骨架的雜質，乙酸則更像是固相多肽合成的“天敵”。由于分子量小且也會被活化劑活化，具有高反應活性，即便痕量乙酸也會在固相合成過程中截斷延伸的肽鏈。有很多人覺得一點點乙酸，無關緊要。那咱們來做個數學題：
Fmoc-Arg(Pbf)-OH受到低至0.1%的乙酸污染，就相當于1mol%的乙酸污染。但如果考慮到通常試劑用量會超出5倍，而高反應活性乙酸會先于氨基酸與肽段結合，則每次循環會造成高達5%的鏈終止。如果合成的多肽含有3%的精氨酸殘基，則意味著15%的鏈會終止。
下圖是實例展示。僅僅0.1%的乙酸污染對于21 mer多肽合成的影響；截斷的副產物采用“*”表示。
Fmoc-氨基酸中的乙酸很難檢測，默克專門開發了標準Fmoc-氨基酸中乙酸定量的方法。跟所有工業產品一樣，氨基酸原料的純度也存在批次差異。這里有個規律，純度越高，差異性就越小。
序列相同的多肽，不同批次間存在差異，這個無法避免。序列不同的多肽，本身的性質也有差異，比如聚集 – 疏水性多肽的濃度越高，聚集也越高，活性主要取決于聚集形態下的活性。
此外，穩定性也很重要。多肽在儲存過程中會有化學轉變。比如含有Asp-Gly的多肽導致形成iso-Asp，多肽中的Cys通過形成二硫鍵而交聯以及Met氧化成亞砜和焦谷氨酸形成。這些雜質有可能帶有細胞毒性，比如二硫蘇糖醇（DTT）。
除了純度之外，多肽的穩定性跟儲存有關，凍干狀態常比溶液更穩定；再一個影響穩定性的因素就是氨基酸組成和序列，所謂sequence depends！
水解：含Asp (D)的多肽的常見問題。含有Asp-Pro (D-P)或Asp-Gly (D-G) 組合的多肽容易脫水，形成環狀亞胺中間體。另外，含有Ser (S) 的序列也可能形成可切割肽鏈的環狀亞胺中間體。
氧化：Cys (C)和Met (M)殘基是發生可逆氧化的主要氨基酸。甲硫氨酸殘基發生氧化后形成甲硫氨酸亞砜和/或甲硫氨酸砜，很難逆轉。
二酮哌嗪和焦谷氨酸形成：二酮哌嗪形成通常發生在甘氨酸(G)位于N末端第3位點時，Pro (P)或Gly (G)位于第1或第2位點時更易發生。如果Gln (Q)位于序列的N末端位點，則焦谷氨酸形成幾乎是不可避免的。這種轉變也可能發生在N末端位點含有Asn (N)的多肽序列中，但可能性較小。
歸根到底，想要高質量的多肽產品，就一定需要高品質的原料和試劑。
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